甜瓜根、茎、叶、花、果、果蒂、果皮、种子均可供药用，可参阅中医药相关资料。全草解毒消肿，治痔疮肿毒、痔漏管瘤、脏毒滞热。
果肉味甘，性寒无毒，清热利尿、止渴，可治暑热、发烧、中暑、口渴、小便不利、口鼻生疮。
茎 治鼻中息肉，齆鼻。
叶 治头癣，生发。
花 治心痛咳逆，外用治疗毒疮。
皮 治热病，烦渴，牙痛。
蒂（果柄）治食物中毒、食积不化，痰盛湿阻、急、慢性肝炎、肝硬化。
种子 散结消瘀、清肺化瘀、润肠、排脓。治腹内结聚、肠癰、咳嗽痰沫、大便不畅。
甜瓜蒂著录於《神农本草经》为上品之药，另从湖南马王堆西汉古墓女屍解剖内发现有甜瓜子，由此得知我国栽培甜瓜食用、药用甚古，应有二千年以上历史了。
据近代研究发现甜瓜蒂含苦毒素，具有催吐作用，因能刺激胃黏膜引起呕吐，适量内服可急救食物中毒，而不会被胃肠吸收，故无虚脱及中毒等害处。中医原为催吐药，能催吐胸膈痰症、宿食停聚和食物致毒食物。
我国生药学家叶橘泉著《食物中药与便方》记载：可治黄疸及无黄疸型传染性肝炎、肝硬化病。用甜瓜蒂烘干或焙乾，研细末，取0.1公克，分六份，先用两份，从两鼻深深吸入，约四十分钟後，清洁鼻腔後再吸两份，再隔四十分钟再吸两份，分三次将○．一公克药量吸完。每隔七日後用同法再做一次，吸完○．四克为一疗程。普通一般性肝炎，两个疗程便见效果，肝硬化则约三～五个疗程。
吸药後常使鼻腔流出大量黄水，吸药时患者头须向前倾，让黄水顺利流出，切勿吞嚥，以免引起腹泻。有时出现头痛、畏寒发热等类似感冒症状，肝脾疼痛加剧，不过大多一天左右症状可自然消失。据临床实验报告效果良好。
如用治慢性肥厚性鼻炎可用瓜蒂末，吹喷鼻中患处，一日二～三次。
我国生药学家叶橘泉著《食物中药与便方》记载：可治黄疸及无黄疸型传染性肝炎、肝硬化病。用甜瓜蒂烘干或焙乾，研细末，取0.1克，分六份，先用两份，从两鼻深深吸入，约四十分钟後，清洁鼻腔後再吸两份，再隔四十分钟再吸两份，分三次将0.1克药量吸完。每隔七日後用同法再做一次，吸完0.4克为一疗程。普通一般性肝炎，两个疗程便见效果，肝硬化则约三～五个疗程。
吸药後常使鼻腔流出大量黄水，吸药时患者头须向前倾，让黄水顺利流出，切勿吞嚥，以免引起腹泻。有时出现头痛、畏寒发热等类似感冒症状，肝脾疼痛加剧，不过大多一天左右症状可自然消失。据临床实验报告效果良好。
